W ramach działań bieżących TOE Rada Zarządzająca powołała następujące zespoły zadaniowe, uczestniczące w pracach związanych z rynkiem energii:

1. Zespół ds. energii odnawialnej (OZE) i produkowanej w kogeneracji i efektywności energetycznej – zajmuje się problematyką handlu energią odnawialną (OZE) oraz produkowaną w kogeneracji, w tym problematyką handlu prawami majątkowymi wynikającymi ze świadectw pochodzenia energii z OZE i z kogeneracji, a także od 2007 roku zagadnieniami związanym z wdrożeniem tzw. dyrektywy efektywnościowej;
   
   
2. Zespół ds. rynku bilansującego – zajmuje się sprawami związanymi z problematyką bilansowania energii elektrycznej oraz zmianami na rynku hurtowym;
   
   
3. Zespół ds. rynku detalicznego – zajmuje się tematyką i sprawami związanymi ze sprzedażą energii elektrycznej do odbiorców końcowych na tzw. rynku detalicznym, w tym obszarem generalnych umów dystrybucyjnych i umów kompleksowych, a także ujednoliceniem procedury zmiany sprzedawcy;
   
   
4. Zespół ds. giełdy - zajmuje się monitorowaniem rynku giełdowego w Polsce i w UE;
   
   
5. Zespół ds. giełdowych instrumentów finansowych - obejmujący zagadnienia finansowe działalności segmentu giełdowego w Polsce, ze szczególnym uwzględnieniem zagadnień dot. obrotu instrumentami finansowymi, utworzenia i działania izb rozliczeniowych, uruchomienia na parkiecie nowych rynków terminowych, itp.;
   
   
6. Zespół ds. wymiany międzysystemowej – uczestniczy w pracach związanych ze skoordynowaniem z innymi krajami zasad wymiany międzysystemowej energii elektrycznej oraz zajmuje się problematyką związaną z uwarunkowaniami formalno – prawnymi wymiany, w tym wdrożeniem tzw. market coupling;
   
   
7. Zespół ds. Raportu TOE - zespół od 2009 roku przygotowuje cykliczny – rocznych raport TOE dot. polskiego rynku energii elektrycznej;
   
   
8. Zespół ds. wskaźnika/indeksu polskiego rynku energii elektrycznej – Zespół opracował i wdrożył wspólnie z międzynarodową agencją informacyjną Platts pierwszy pozagiełdowy wskaźnik polskiego rynku;
   
   
9. Zespół ds. umowy EFET – celem zespołu jest ujednolicenie i wdrożenie w Polsce, funkcjonującej w wielu krajach Unii standardowej umowy zakupu/sprzedaży energii elektrycznej; Zespół w 2005 i 2006 opracował i wdrożył na rynku polskim jednolite tłumaczenie standardu umowy EFET;
   
   
10. Zespół ds. modelu rynku energii elektrycznej - celem prac, powołanego na początku 2007 roku, zespołu była ocena istniejących modeli rynku energii elektrycznej, propozycji zmian tego rynku w Polsce, a także wypracowanie docelowego modelu rynku energii elektrycznej, uwzględniającego politykę energetyczną Unii Europejskiej oraz współpracę w ramach tworzących się rynków regionalnych.
    
    
11. Zespół ds. rynku gazu - misją powołanego w 2012 roku jest aktywne, świadome i pełnoprawne uczestnictwo w kształtującym się rynku gazu w Polsce poprzez udział w przygotowywaniu, recenzowaniu i wdrażaniu prawnej, regulacyjnej oraz biznesowej infrastruktury tego rynku.